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世界觀天下!輸入疾病信息即可生成靶點(diǎn)?AIGP大模型平臺(tái)發(fā)布


【資料圖】

“輸入病人疾病相關(guān)的多組學(xué)數(shù)據(jù),如胃癌病人,AIGP平臺(tái)即能夠分析其多組學(xué)數(shù)據(jù),找到針對(duì)這個(gè)胃癌病人的靶點(diǎn),根據(jù)這個(gè)靶點(diǎn)生成一個(gè)抗體甚至一系列有多樣性的蛋白。最后,一鍵式生成的蛋白回到自動(dòng)實(shí)驗(yàn)室里合成蛋白。”3月23日,在百圖生科基于生命科學(xué)大模型驅(qū)動(dòng)的AIGP平臺(tái)發(fā)布會(huì)上,百圖生科CTO 宋樂(lè)說(shuō)。

宋樂(lè)在介紹AIGP平臺(tái)。 主辦方供圖。

宋樂(lè)介紹,上面所說(shuō)的只是AIGP平臺(tái)其中一個(gè)功能,其還可以根據(jù)形狀及理化性質(zhì)(物理性質(zhì)和化學(xué)性質(zhì))需求,生成一系列滿足需求的蛋白。再就是根據(jù)一個(gè)蛋白質(zhì)靶點(diǎn)生成對(duì)應(yīng)和靶點(diǎn)結(jié)合的蛋白,比如針對(duì)新冠病毒生成一個(gè)蛋白,甚至針對(duì)石油相關(guān)的分子生成一個(gè)酶。

據(jù)了解,過(guò)去兩年多,百圖生科構(gòu)建了生命科學(xué)領(lǐng)域千億參數(shù)的跨模態(tài)大模型“xTrimo”。該大模型從跨物種、跨模態(tài)的生命信息中學(xué)習(xí)蛋白質(zhì)如何構(gòu)成和實(shí)現(xiàn)功能、如何相互作用、如何組合和調(diào)控細(xì)胞功能的關(guān)鍵規(guī)律,從而破解生命的自然語(yǔ)言 —— 蛋白質(zhì)。基于大模型,AI在一系列任務(wù)算法上取得了明顯進(jìn)展,除了更好地完成結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)等基礎(chǔ)任務(wù)外,也開(kāi)始可以根據(jù)不同的問(wèn)題輸入,以生成的方式,設(shè)計(jì)創(chuàng)新的蛋白質(zhì),來(lái)回答各種生命科學(xué)問(wèn)題。

目前,平臺(tái)設(shè)置了3類功能模塊,分別是Function to Protein Design(F2P,根據(jù)結(jié)構(gòu)、功能、可開(kāi)發(fā)性等功能指標(biāo)設(shè)計(jì)/優(yōu)化蛋白質(zhì))、Protein to Protein Design(P2P,給定抗原等目標(biāo)蛋白,設(shè)計(jì)與之以特定方式結(jié)合的抗體等蛋白質(zhì)),以及Cell to Protein Design(C2P,給定細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)調(diào)控細(xì)胞功能的靶點(diǎn)蛋白并設(shè)計(jì)相應(yīng)的調(diào)控蛋白)。

宋樂(lè)表示,此次平臺(tái)的發(fā)布,旨在將這一技術(shù)平臺(tái)的能力與更多行業(yè)人士分享,利用AI設(shè)計(jì)創(chuàng)新蛋白質(zhì)的能力,共同研發(fā)更多的前沿藥物和其他生命科學(xué)項(xiàng)目,也通過(guò)一系列挑戰(zhàn)性的新任務(wù),驅(qū)動(dòng)AIGP平臺(tái)的技術(shù)進(jìn)步。此前,AIGP平臺(tái)已經(jīng)進(jìn)行了一段時(shí)間的內(nèi)部測(cè)試,在創(chuàng)新免疫調(diào)控藥物ImmuBot的研發(fā)中,貢獻(xiàn)了多個(gè)高性能彈頭、新功能傳感器的研發(fā)案例。

中國(guó)科學(xué)院院士、著名免疫學(xué)家董晨教授認(rèn)為:“AI能夠解決的問(wèn)題,就是對(duì)大數(shù)據(jù)的分析和進(jìn)一步的演繹和應(yīng)用。在當(dāng)下的時(shí)間節(jié)點(diǎn),AIGP確實(shí)是一個(gè)呼之欲出的平臺(tái)。相信AIGP對(duì)于我們理解蛋白質(zhì),以及在生物系統(tǒng)中研究和發(fā)現(xiàn)它的功能和調(diào)控,乃至于將來(lái)研發(fā)新藥,都會(huì)有非常大的作用。”

百圖生科CEO劉維表示,雖然當(dāng)前AI大模型和與之配套的大規(guī)模數(shù)據(jù)圖譜、高通量驗(yàn)證體系都遠(yuǎn)不完美,但已經(jīng)凝結(jié)了很多前沿技術(shù)的創(chuàng)新和探索,接下來(lái),從開(kāi)始展露一些能力到提高它的泛化能力和速度,需要更多專業(yè)人士的加入,以實(shí)現(xiàn)前沿項(xiàng)目的加速研發(fā)。

宋樂(lè)也表示,當(dāng)前,根據(jù)不同模塊的輸入和要求,AIGP平臺(tái)可在較短時(shí)間內(nèi)設(shè)計(jì)和生成具有特定性質(zhì)的蛋白質(zhì)。今年6月起,部分功能模塊將進(jìn)一步開(kāi)放,讓專業(yè)用戶可以直接自主使用,在更多的研究場(chǎng)景調(diào)用AI的蛋白質(zhì)生成能力,激發(fā)更多的生命科學(xué)探索。

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