研究發(fā)現(xiàn)人們對數(shù)千種人類蛋白質幾乎一無所知

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一個被稱為unknome的蛋白質數(shù)據(jù)庫根據(jù)人們對蛋白質的了解程度對蛋白質進行排名，結果顯示，人們對數(shù)千種人類蛋白質幾乎一無所知，而其中一些蛋白質對生存至關重要。8月8日，相關成果發(fā)表于《科學公共圖書館—生物學》。

為了創(chuàng)造unknome數(shù)據(jù)庫，英國劍橋大學MRC分子生物學實驗室的Sean Munro和同事從人類身上發(fā)現(xiàn)的大約2萬個蛋白質基因入手。他們將密切相關的、可能具有相似功能的人類基因或蛋白質組合在一起，產生了大約7500個蛋白質簇。

接下來，他們將在老鼠或果蠅等常見研究動物中發(fā)現(xiàn)的密切相關的蛋白質添加到這些蛋白質簇中，因為這些蛋白質可能也具有相同功能。然后，他們根據(jù)基因功能主要信息庫中的條目數(shù)量，給每個蛋白質簇打分。

一種沒有被直接研究過的人類蛋白質，如果其在另一種動物身上的等效蛋白質得到了充分研究，它的得分仍然很高。如果蛋白質在被認為更可靠的條目中出現(xiàn)也會得到更高的分數(shù)，比如發(fā)表在期刊上。 Munro坦言，這種評分有些武斷，但在試圖弄清人們未知的東西時，這是不可避免的。

一些蛋白質被研究得十分透徹，因此其得分遠遠超過100。例如，一種參與胚胎發(fā)育的名為音猬因子的蛋白質得分為168，而幫助阻止細胞癌變的蛋白質p53得分為126。然而，仍有超過2200種蛋白質的得分低于2、1100種低于1、超過800種為0。

理論上，這些得分低的蛋白質可能沒有被研究過，因為它們沒有任何重要的作用。為了解這些蛋白質是否重要，研究小組使用了一種名為RNA干擾的技術，降低果蠅中260種得分低于1的蛋白質的水平。在60個案例中，果蠅死亡，這表明這些特殊的蛋白質具有重要的功能。

Munro說，這對研究果蠅的團隊成員來說是一個很大的驚喜。“他們只是假設已經找到了所有可能的重要基因，事實證明并非如此。”

他說，未知蛋白質的數(shù)量正在慢慢減少，但他希望加快發(fā)現(xiàn)的步伐。目前的問題是，資助機構和研究人員都不愿意冒險研究未知蛋白質，因為他們擔心相關的研究工作無足輕重從而無回報。

“甚至可能有我們不知道的生物過程，但沒有人在尋找與這一過程有關的蛋白質，因為沒有人知道它們。”Munro說，這聽起來可能令人驚訝，但被稱為CRISPR的基因編輯技術是基于細菌蛋白質的，后者的功能直到2012年才被發(fā)現(xiàn)。

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